Implantada num dos locais mais elevados de Lagos, a Igreja de São Sebastião domina cenograficamente o casario como edifício religioso de maior impacto visual da cidade. A primitiva construção remonta ao século XIV, no âmbito do extraordinário crescimento urbano medieval, tendo na segunda metade do século XV o bispo D.

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Implantada num dos locais mais elevados de Lagos, a Igreja de São Sebastião domina cenograficamente o casario como edifício religioso de maior impacto visual da cidade. A primitiva construção remonta ao século XIV, no âmbito do extraordinário crescimento urbano medieval, tendo na segunda metade do século XV o bispo D. João de Mello patrocinado capela que serviu de capela-mor, mudando o orago de Nossa Senhora da Conceição para São Sebastião. A profunda remodelação quinhentista criou um dos mais interessantes exemplos da arte renascentista algarvia. O portal lateral sul, referido por José Eduardo Horta Correia como dos primeiros testemunhos do Renascimento algarvio, exibe decoração grutesca fitomórfica e zoomórfica com figuras das cantoneiras "tipologicamente renascentistas, mas executadas por mãos manuelinas". Duas pilastras lavradas sustentam verga direita com cabeças de anjo em relevo, enquadrando arco de volta perfeita com pedra de fecho representando ave.

O interior de três naves de cinco tramos sem transepto organiza-se por arcos de volta perfeita assentes em colunas de capitéis parcialmente jónicos, criando ampla igreja-salão. O portal axial maneirista contrasta pela decoração contida limitada a geometrismo das formas, sem escultura figurativa.

O terramoto de 1755 destruiu torre sineira e sectores do telhado, reconstruídos no período barroco. Os grandes retábulos neoclássicos conservados devem-se ao arquitecto Francisco Xavier Fabri, nome marcante do século XIX algarvio. A Capela dos Ossos com retábulo joanino constitui um dos raros exemplos desta tipologia, conferindo singularidade excepcional ao conjunto monumental lagosense.

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